在生態缸開始運行的初期，缸內生態系統處于初步建立正逐漸完善成熟的步驟，本身還比較脆弱，同時缸內水草等生物，同樣處于生根適應環境的時候，本身亦比較脆弱，所以在開缸初期，需要我們格外的精心照顧。

市面上我們能夠從水族商那里買來的水草，一般都是陸生培育出來的，極少會有商家出售水生水草，所以我們買來入缸后一般都會有一個陸生轉水的過程，在這過程中，陸生葉會轉黃腐爛脫落之后長出水生葉。而在這過程中，由于葉片的脫落轉換，其光合作用并沒有那么頻繁，如果這時候光照太強的話，很可能會引起水草的死亡，同時強光照，也為藻類的滋生提供和便捷的環境。

所以在開缸初期，光照的時間我們應該逐步增加，開缸一周每天三小時增加至每天五小時，第二周開始維持每天五小時，第三周逐漸增加至每天八小時，從第四周開始一直維持每天八至九小時的光照時間，讓水草有一個陸轉水以及適應環境的過程。這中間的時間，可以根據缸內水草的實際狀態做出相應的調整。

基于與光照設置同樣的原因，在開缸初期，二氧化碳的供給量也應該是逐步添加，過量的二氧化碳供給配合強烈的光照，是開缸初期藻類大量爆發的重要原因之一。

二氧化碳的供給量沒有相對定量的標準，不同尺寸的缸二氧化碳的供給量相差較大，所以這個量的增加無法具體來表達，謹遵循一個原則，在開缸初期，二氧化碳的供給量寧少勿多，等缸內水草生根并且有了生長的趨勢后，就可以適當增加二氧化碳的供給了。

水溫是一個相對變量的條件，大多數水草適宜生長的環境溫度在26度左右，過低或者過高都會減緩生長速度甚至死亡，而且不同于兩棲爬行等動物或者是部分食蟲植物，為了來年的成長需要一個低溫冬化的過程，所以我們一般都會將缸內的水溫維持在26度。